荷蘭植物生態(tài)表型中心（Netherlands Plant Eco-phenotyping Centre，NPEC）由荷蘭瓦赫寧根大學(xué)（Wageningen University & Research, WUR）與烏得勒支大學(xué)（Utrecht University） 共同合作建設(shè)和運營。中心于2017年遞交提案，2022年9月底正式啟用，研究重心在于植物表型與環(huán)境的相互關(guān)系，力圖將植物研究引入自動化和大數(shù)據(jù)的時代。

NPEC在幾年時間中陸續(xù)建設(shè)完成了六大研究模塊，其中包括3套安裝在FytoScope大型步入式水培植物生長室中的PlantScreen XYZ三維移動式植物表型成像分析系統(tǒng)、1套PlantScreen-SC移動式植物表型成像分析系統(tǒng)、36單元Ecolab土壤-植物-大氣綜合研究微生態(tài)系統(tǒng)、多套FluorCam葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)等。

2023-2024年，NPEC安裝完成了兩套最新型的植物表型成像系統(tǒng)。NPEC分別將其命名為“太陽神"（Helios）和 “冥王"（Hades）。其中“太陽神"（Helios）系統(tǒng)為一套PlantScreen傳送帶版高通量植物表型成像分析系統(tǒng)。這套系統(tǒng)利用傳送帶將植物傳送到成像室中進行測量，實現(xiàn)了高通量、高精度、低干擾、多角度的植物表型成像測量，同時還可自動控制植物的生長環(huán)境，包括澆灌、光照、溫度及動態(tài)周期變化等。

“冥王"（Hades）系統(tǒng)則為一套PlantScreen高通量瓊脂培養(yǎng)植物表型成像分析系統(tǒng)。這是一套專門為瓊脂平板培養(yǎng)植物進行自動接種、培養(yǎng)與表型成像分析的系統(tǒng)。該系統(tǒng)為全自動機器人操作，包括傾倒瓊脂、播種、層積催芽、接種、成像分析全自動運行。可容納2160個特制培養(yǎng)皿的全自動全流程高通量表型分析。系統(tǒng)由具備GMO（轉(zhuǎn)基因生物）控制區(qū)的環(huán)控室、操作臺、培養(yǎng)柜（包括層積催芽柜）、機器人及成像工作站等組成，可進行根系形態(tài)成像分析、GFP等熒光蛋白成像分析、葉綠素?zé)晒獬上穹治觥⒍喙庾V成像分析、高光譜成像（透射光）分析及熒光高光譜成像分析等

NPEC利用這些表型組學(xué)設(shè)備已經(jīng)開展了一系列研究工作并取得了大量的科研成果，部分研究案例如下：

1. 利用葉綠素?zé)晒夥治鰧Ψ阎旭R鈴薯胞囊線蟲感染進行非侵入性、癥狀前檢測

馬鈴薯胞囊線蟲（PCN）是全球馬鈴薯產(chǎn)區(qū)破壞性的病原線蟲之一，每年造成巨大的經(jīng)濟損失。PCN在田間的侵染通常呈“病灶"狀分布，即僅在某些區(qū)域集中發(fā)生。然而，早期、精準(zhǔn)地定位這些病灶非常困難，因為傳統(tǒng)的土壤取樣和線蟲鑒定方法既耗時又費力。因此，開發(fā)一種快速、非破壞性、癥狀前的檢測技術(shù)，對于實現(xiàn)精準(zhǔn)的局部防控、減少農(nóng)藥使用和降低經(jīng)濟損失具有重要意義。本研究旨在探索葉綠素?zé)晒夥治鲎鳛橐环N前沿的植物生理監(jiān)測技術(shù)，是否能夠通過檢測植物地上部光合系統(tǒng)的細(xì)微變化，來間接、早期地診斷出地下部根系的PCN侵染。

研究人員將番茄種植于PlantScreen高通量傳送帶表型系統(tǒng)的樣品托盤中，設(shè)置了5個不同梯度的PCN接種密度，利用PlantScreen系統(tǒng)的FluorCam葉綠素?zé)晒獬上駟卧诮臃N后連續(xù)自動監(jiān)測26天的葉綠素?zé)晒鈩討B(tài)成像。

研究發(fā)現(xiàn)，葉綠素?zé)晒鈪?shù)對PCN侵染的響應(yīng)遠早于傳統(tǒng)生長指標(biāo)：

1）極早期響應(yīng)： 在接種后第1天，反映光合速率的ΦPSII和光合系統(tǒng)熱耗散的NPQ就發(fā)生了顯著變化。此時，線蟲可能尚未侵入根系，研究者推測可能是線蟲卵自發(fā)孵化或其分泌的特定分子（效應(yīng)子）觸發(fā)了植物的早期免疫反應(yīng)所致。

2）高靈敏度： ΦPSII是對低水平侵染最敏感的指標(biāo)。即使在接種密度（5卵/克土）下，從第1天起就能檢測到其下降。而NPQ則在第1天對高接種密度表現(xiàn)出響應(yīng)。

最大光化學(xué)效率Fv/Fm、PSII潛在活性Fv/F0則響應(yīng)較晚且對低侵染水平不敏感。

本研究成功證明了：葉綠素?zé)晒夥治觯貏e是NPQ和ΦPSII這兩個參數(shù)，能夠作為一種極其靈敏的工具，在番茄植株出現(xiàn)任何可見癥狀之前，有效檢測出地下部的馬鈴薯胞囊線蟲侵染。

2. 馬鈴薯對單一和復(fù)合脅迫的高通量表型成像分析

隨著氣候變化加劇，熱浪、洪澇和干旱等天氣事件頻發(fā)，嚴(yán)重威脅作物生產(chǎn)。馬鈴薯作為全球重要的糧食作物，其生長和產(chǎn)量極易受到不良環(huán)境條件的影響。本研究旨在對馬鈴薯（栽培種 'Désirée'）應(yīng)對單一及復(fù)合非生物脅迫（高溫、干旱、澇漬）進行綜合性分析，通過整合高通量表型分析和多組學(xué)數(shù)據(jù)，深入理解馬鈴薯在模擬未來現(xiàn)實氣候情景下的脅迫響應(yīng)機制，并建立了一個生物信息學(xué)分析流程來整合這些復(fù)雜數(shù)據(jù)。這項研究由包括荷蘭瓦赫寧根大學(xué)和烏得勒支大學(xué)在內(nèi)的多家歐洲學(xué)術(shù)與科研單位參與，是歐盟ADAPT馬鈴薯育種項目的重要研究成果之一。

研究人員對馬鈴薯植株施加單一脅迫（熱應(yīng)激 H、干旱 D、澇漬 W）以及復(fù)合脅迫（熱+干旱 HD、熱+干旱+澇漬 HDW），并設(shè)置恢復(fù)期，以模擬田間可能出現(xiàn)的連續(xù)脅迫，并使用PlantScree高通量表型成像分析系統(tǒng)進行連續(xù)表型分析，監(jiān)測植物體積、高度、葉面積、緊湊度等形態(tài)指標(biāo)，以及葉綠素?zé)晒猓ㄈ?/span>QY_Lss, Fv/Fm_Lss, qL_Lss）和熱成像（冠層溫度ΔT）等生理指標(biāo)。結(jié)果表明，所有脅迫均抑制生長，但程度不同，復(fù)合脅迫HD的影響大于單一脅迫；澇漬（W）的影響最迅速和嚴(yán)重；三重脅迫（HDW）導(dǎo)致植株近乎死亡。而在光合系統(tǒng)損傷中，所有脅迫均降低了PSII的光化學(xué)效率（QY_Lss），其中熱應(yīng)激H脅迫影響最大。

結(jié)合其他組學(xué)數(shù)據(jù)，該研究證實了馬鈴薯對復(fù)合脅迫（尤其是熱+干旱+澇漬HDW）的敏感性，同時明確了高溫脅迫通過抑制光合作用和塊莖形成信號（SP6A）來影響產(chǎn)量的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。該研究可為馬鈴薯抗逆育種提供重要的候選靶點和診斷工具，有助于加速培育適應(yīng)未來氣候變化的馬鈴薯品種。

3. 在高通量表型系統(tǒng)進行單個葉片的光合能力追蹤測量

植物光合作用研究對生產(chǎn)力和產(chǎn)量至關(guān)重要。隨著高通量表型系統(tǒng)設(shè)施的發(fā)展，光合表型的測量變得可靠、高效。然而，盡管植物級別的表型分析已自動化，但葉片級別的信息通常仍依賴于手動標(biāo)注，限制了研究效率。本研究提出了一種新方法，用于在植物（以擬南芥為例）的頂部拍攝圖像時間序列中，對單個葉片進行自動檢測、分割和追蹤。

研究者將兩個擬南芥生態(tài)型（Col-0 和 Ely）在PlantScree XY三維移動表型成像系統(tǒng)中進行不同光處理（恒定光與波動光），并分析其光合參數(shù)（最大光量子產(chǎn)量Fv/Fm和光系統(tǒng)II實際效率ΦPSII）。植株級別葉綠素?zé)晒獬上穹治霰砻?/span>Col-0的Fv/Fm和ΦPSII均顯著高于Ely，且Ely的光合參數(shù)對波動光處理的響應(yīng)更明顯。葉片級別葉綠素?zé)晒獬上穹治鰟t進一步表明葉片年齡和葉序顯著影響光合能力及其對光處理的響應(yīng)。在Ely中，葉片Fv/Fm在其出現(xiàn)約一周后達到峰值然后下降；幼葉對波動光的ΦPSII響應(yīng)比老葉更強烈。

該方法能夠高效、自動化地追蹤單個葉片，為研究葉片發(fā)育、光合作用動態(tài)及其遺傳基礎(chǔ)提供了有力的新工具。

4. 不同光照強度對羅勒采后耐冷性的影響

羅勒（Ocimum basilicum L.）作為熱帶草本植物，在低于10–12℃的低溫貯藏時易發(fā)生冷害，表現(xiàn)為葉片褐斑、壞死、失去光澤等。本研究希望通過采收前短期高光處理（EOP）提升羅勒的碳水化合物和抗氧化物質(zhì)含量，看是否能夠增強其采后耐冷性。研究人員將兩個羅勒品種（Emily 和 Dolly）在垂直農(nóng)業(yè)系統(tǒng)中，使用LED光源（150 μmol·m?2·s?1）進行培養(yǎng)。采收前5天，分別施加50、150、300、600 μmol·m?2·s?1的光照強度。采后葉片在4°C（冷害條件）和12°C（非冷害條件）下黑暗貯藏12天，定期取樣分析。

利用FluorCam葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)測量后發(fā)現(xiàn)，羅勒葉片最大光化學(xué)效率Fv/Fm在4°C貯藏下顯著下降，但EOP光強對其無顯著影響。Fv/Fm反映了植物光合反應(yīng)中心在脅迫條件下的損傷程度，是目前衡量植物受脅迫程度與抗性高低的指標(biāo)之一。因此，結(jié)果表明，EOP高光可有效提升羅勒的營養(yǎng)價值（碳水化合物、迷迭香酸、抗壞血酸），但未能增強羅勒的耐冷性。

參考文獻：

1. van Himbeeck R, Binneb?sz E L, Amora D, et al. Noninvasive, Presymptomatic Detection of Potato Cyst Nematode Infection in Tomato Using Chlorophyll Fluorescence Analysis[J]. Phytopathology, 2025, 115(1): 77-84.

2. Zagor??ak M, Abdelhakim L, Rodriguez-Granados N Y, et al. Integration of multi-omics data and deep phenotyping provides insights into responses to single and combined abiotic stress in potato[J]. Plant physiology, 2025, 197(4): kiaf126.

3. Jurado-Ruiz F, Nguyen T P, Peller J, et al. LeTra: a leaf tracking workflow based on convolutional neural networks and intersection over union[J]. Plant Methods, 2024, 20(1): 11.

4. Larsen D H, Li H, van de Peppel A C, et al. High light intensity at End-Of-Production improves the nutritional value of basil but does not affect postharvest chilling tolerance[J]. Food Chemistry, 2022, 369: 130913.

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